おはよう諸君、僕はクリス博士だ。マッドブラック皇帝よりタチの悪い4人の闇の支配者を倒し、全宇宙を崩壊の危機から救った。しかし今まで倒した4人の闇の支配者は闇の9級支配者に過ぎなかった。次に倒すべき敵は闇の9級支配者の上位に位置する闇の8級支配者だ。奴は懸賞金が300テラクレジットを軽く超える実力を持つ存在だ。つまり闇の9級支配者の上位に位置する闇の8級支配者を倒さなければならない。一ヶ月半の修行を終えて闇の支配者たちを倒せるだけ倒して強くなった僕らなら必ず勝てるはず。惑星エバニメトピアのある地ノ川銀河(Earth River Galaxy)を飛び出し七ツ国銀河へ大冒険！さあ、今度こそ宇宙の平和と自由を取り戻そう！
第12章：霧崎晃編
前作で闇の支配者を全滅！→今回は？：諸悪の根源である闇の支配者の親玉打倒を目指す！
クリス博士の仲間たち：娘たち、アイリス、アンドリュー、チャーリー、裕五郎、シャイニープリンセス
次なる敵：霧崎晃
敵の手下の数：800人
敵の懸賞金：708テラクレジット
果たしてどうなる！？：果たしてクリス博士は霧崎晃を倒すことが出来るのか！？全ての宇宙に平和が戻るのか！？
第13章：レックス・オコナー編
見事霧崎晃を撃破！→クリス博士の懸賞金は？：クリス博士の懸賞金は900テラクレジットに増額！
次にやることは？：シャイニーヘキサグラム王国へ向かいシャイニープリンセスに会いに行く！
衝撃事実その1：恐怖と闇と破滅の魔王ドレッド・ダークマターとそれに仕えるダークマター七本槍の存在が明かされ、霧崎晃はその七本槍の一の槍に過ぎなかった！
次に倒すべき敵：ダークマター七本槍・二の槍兼闇の7級支配者レックス・オコナー
敵の手下の数：1263人
敵の懸賞金：2.43ペタクレジット
捕らわれのお姫様：ローズ姫（惑星アスメラルディアを治めていたお姫様でその数は8兆人！）
果たしてどうなる！？：果たしてクリス博士はレックスを倒すことが出来るのか！？捕らわれたローズ姫を救出できるのか！？
第14章：ロジャー・レッドフィールド編
見事レックスを撃破！→今度の懸賞金は？：クリス博士の懸賞金が3ペタクレジットに増額！
次なる敵は？：ダークマター七本槍・三の槍兼闇の6級支配者ロジャー・レッドフィールド
新たに登場する重要人物：ガース・ウォルステンホルム（クリス博士のお父さん）
衝撃事実その2：裕五郎の先祖が完全に倒し損ねていた阿久野龍一郎は既にガースによって完全に倒されていた！
新たにTeam NPLの仲間に加わった者：エイデン・スターリング
敵の手下の数：1275人
敵の懸賞金：8.96ペタクレジット
捕らわれのお姫様：アイヴィー姫（ローズ姫のお友達で一緒によく遊ぶほど仲が良かったお姫様仲間）を含み全部で80兆人！
果たしてどうなる！？：果たしてクリス博士はロジャーを倒すことが出来るのか！？捕らわれたアイヴィー姫を救出できるのか！？
第15章：デューク・ドゥームズデイ編
見事ロジャーを撃破！→新たな懸賞金は？：クリス博士の懸賞金が9ペタクレジットに増額！
次のミッションは？：ドレッド・ダークマターを倒すのに必要不可欠な6つ目のクリストリウムクリスタル、イグナイティアを手に入れろ！
イグナイティアの在り処：惑星マウンジョングォ
次に倒すべき敵は？：ダークマター七本槍四ノ槍兼闇の準5級支配者デューク・ドゥームズデイ
敵の居場所：惑星バイオリテイン（ガースの弟弟子の1人ヘンリーの生まれ故郷）
敵の手下の数：1311人
敵の懸賞金：34.1ペタクレジット
新たなる仲間：アドーラ・アンダーソン（前作では敵として立ちはだかったが、今回は仲間に！）
捕らわれのお姫様：ノエル姫（ローズ姫やアイヴィー姫とはとても仲が良いお友達）を含み、全部で878兆人！
果たしてどうなる！？：果たしてクリス博士はデュークを倒し、捕らわれたノエル姫を救出できるのか！？全宇宙滅亡の危機を防ぐことが出来るのか！？
第16章：オズワルド・バルタザリアン編
見事デュークを撃破！→そして懸賞金は？：クリス博士の懸賞金が35ペタクレジットに増額！
ドロップアイテム：ダークマター城に入るための七つの鍵
次なるミッションは？：あらゆる攻撃を跳ね返す7つ目のクリストリウムクリスタル、リフレクティアを手に入れろ！
次に倒すべき敵は？：オズワルド・バルタザリアン
トラブルその1：ドレッド・ダークマターが妃にする方針から生命力、寿命、美しさを奪う方針に変え、全ての宇宙は滅亡の危機に！
新たなる重要人物1：七ツ国銀河の女王様、チャーリーの父親ダレスとその師匠ネイサン
敵の居場所：セクター・レッド 惑星クリムゾークシティ
敵の手下の数：1924人
敵の懸賞金：158ペタクレジット
捕らわれのお姫様の数：ローズ姫、アイヴィー姫、ノエル姫、チェリー姫合わせて1京7558兆人！
トラブルその2：ネイサンは3000年前にルーク・ライトアームズに敗れ死亡していた！
新たなる仲間：カイ・ハルバード（普段は30分の1に縮小しており、本当は身長25メートルを超える幼き巨人の男の子！）
新たな仲間の実力：イグナイティアとブースティアの力を借りただけで、重量20億トンのハルバードジェットハンマーを使ってオズワルド・バルタザリアンの闇の結界を破壊！
トラブルその3：宇宙警察が本部からの勅令によってクリス博士を武力行使で抹殺しようと動き出す！→アドーラが宇宙警察を挑発・足止め！
果たしてどうなる！？：果たしてクリス博士はオズワルドを倒し、捕らわれたお姫様の生命力と寿命と美しさを取り戻すことができるのか！？そして全ての宇宙に平和が戻るのか！？
第17章：アレハンドロ・アルメンダリス編
見事オズワルドを撃破！→さあ懸賞金は？：クリス博士の懸賞金が235ペタクレジットに増額！
新たな戦力①：クリストリウムクリスタル・リジェネレーティアで再生能力が使えるように！
新たな戦力②：宇宙戦闘母艦エンプレスデッセイ号が完成し、ジャニス皇女が自ら出陣できるように！
次に倒すべき敵：ダークマター七本槍六ノ槍 アレハンドロ・アルメンダリス
敵の手下の数：4254人（しかし、最大出力のエンプレスD5レイの余波で全滅！）
敵の懸賞金：1.58エクサクレジット
敵の居場所：惑星ニュークロスシティ
捕らわれのお姫様の数：ローズ姫、アイヴィー姫、ノエル姫、チェリー姫、エメラ姫合わせて合計351京1596兆人！
新たな戦力③：解放を司るリリーシアで限界以上の実力を発揮できるように！
新たな戦力④：ゴールドグリッターキーのアップグレード版、プラチナグリッターキーを使って黄金の光より強力な白金の光を纏えるように！
衝撃事実：ジャニス皇女の祖父サイモンは500年間に渡って惑星ニュークロスシティの衛星軌道を拠点に軍隊を集めていたほか、アレハンドロ・アルメンダリスとの因縁に決着をつけた後はついでにドレッド・ダークマターを倒すつもりだった！
果たしてどうなる！？：果たしてクリス博士はアレハンドロを倒し、ダークマター城に入るための六つ目の鍵を手に入れることが出来るのか！？そしてお姫様の生命力と寿命と美しさを取り戻すこともできるのか！？
第18章：ルーク・ライトアームズ編
見事アレハンドロを撃破！→懸賞金は？：クリス博士の懸賞金が2.35エクサクレジットに増額！
次に倒すべき敵：ダークマター七本槍七ノ槍 ルーク・ライトアームズ
パワーアップ①：フォートレスワープクルーザーXLが進化し、ネオフォートレスワープクルーザーXLに！
パワーアップ②：娘たちが増殖し、6762億6010万0041人から、81兆0270億0900万3000人に増えた！
パワーアップ③：アンドリューとチャーリーの超特空機が改造によって大幅に強化！
パワーアップ④：リリーシアで裕五郎の刀とカイのハンマーが真の力を解き放つ！
パワーアップ⑤：ブースティアで増幅できるのは50倍が限界なのは力不足だった！
パワーアップ⑥：インフレーティアで通常の100倍の大きさまで超巨大化！
敵の手下の数：9369人（過去最多！しかも2つの惑星を占拠！）
敵の懸賞金：34エクサクレジット
敵の居場所：暗黒宇宙大要塞・右腕城塞
捕らわれのお姫様の数：581垓0095京1996兆人（奪われた生命力と寿命と美しさは6人の幹部と3人の護衛、そしてルーク自身の力に変換された！）
衝撃事実：クリス博士の父ガースとルーク・ライトアームズはかけがえのない親友で、ガースが冒険家になったのはルークの暴走を止めるためだった！
果たしてどうなる！？：果たしてクリス博士はルークを倒すことが出来るのか！？そしてガースはルークと仲直りできるのか！？
最終章：ドレッド・ダークマター編
見事ルークを撃破！果たして懸賞金は！？：クリス博士の懸賞金が50エクサクレジットに増額！
朗報①：ダークマター七本槍の戦闘データを全て入手したことにより、メアリー博士の最終兵器、Y.U.M.E.がついに完成！
次に倒すべき敵：恐怖と闇と破滅の魔王ドレッド・ダークマター
悲報①：日本時間の金曜午後8時から9時の間でなければダークマター城へ入れない！
悲報②：Y.U.M.E.は本来の大きさだとエネルギー満タンでも3秒間しか戦えない！
敵の手下の数：25500人（全員強力な力を持っており、しかもそのうち2人は最高幹部！）
敵の懸賞金：1.58ゼタクレジット
敵の居場所：ダークマター城（大惑星グリングラスガーデンから83兆光年先で方角は北！）
捕らわれのお姫様を含めた七ツ国銀河のお姫様の数：ダークマター七本槍に捕らわれた個体を含め、全部で777杼人！
衝撃事実：7つの鍵の正体はかつてユージーン・シャークスが使っていた伝説の聖剣セブンランド・エクスカリバーだった！
パワーアップ①：裕五郎が超激特大将軍フォームに！
パワーアップ②：アンドリュー、チャーリーの超特空機が進化を遂げる！
パワーアップ③：アドーラがライテンドースイッチで極限パワーアップ！
パワーアップ④：エイデンが持つエイデニウムクリスタルが10個に！
敵の行動①：ユージーン・シャークスからセブンランド・エクスカリバーを奪い、それを7つにわけてダークマター七本槍の武器に仕立て上げていった！
敵の行動②：ドレッド・ダークマターが自らの暗黒瞬間移動魔法でエイデンの究極自爆技を緊急回避し、捕らわれたお姫様全員の場所を移す！
パワーアップ⑤：セブンランド・エクスカリバーとストロングスパークが合体してセブンランド・クリスカリバーになり、クリス博士はクリストラセブンに変身！
悲報③：クリス博士がダークマター七本槍を倒したことで助け出されたお姫様たちもドレッド・ダークマターの暗黒帝王収縮魔法で再び捕らわれの身に！
敵の行動③：ドレッド・ダークマターが全ての宇宙に住む人々を従わせようと告げ、さらに娘たちとエイデンが全滅させた25500人の手下を闇の準初段支配者中層部以上の力を与えて蘇らせ、そこから合体し、グランドレッド・ダークマターに！そしてダークマター本星と一体化してグレートグランドレッド・ダークマターに！
果たしてどうなる！？：果たしてクリス博士はドレッド・ダークマターを倒すことが出来るのか！？そして全777杼7777垓人のお姫様が助かり、全ての宇宙に平和が戻るのか！？